主從和硬件無關，既然“軟件工程師說要用圖二的電路”，說明只用一套485，用2個db9端子，可能是方便背靠背連接。
圖1用了2套485，和實際應用環境不符。

很多設備都可以通過軟件設置為主機或從機，也就是和硬件無關。

從你的描述，圖2就可以了，485不僅涉及與單片機如何連接，也涉及485總線上如何連接，你并沒描述485其他涉及的情況，另外，485芯片的RX是接收輸出，電路圖上沒接錯

RX接RX，TX接TX.

第一：1和2沒有區別，你怕是沒見過一個單品片機帶四五個485的項目吧，我們做項目有時候一個手柄接一個485。3個手柄接3個485，一個屏幕接個232。所以本質上來說第一第二沒有任何區別。多一個手柄和少一個手柄的事。
第二：485通信沒有所謂的主機和從機，就單純硬件而言沒有。我手柄可以通過按鍵控制，按下按鍵后手柄主動發送數據給主機，也可以主機也可以將數據發送給手柄。他兩相互獨立，不是AT24C02那種IIC通信，從機只能應答，只有主機才能主動發送數據。主機和從機是軟件寫出來的，和你硬件沒關系。
第三個：我覺的你家軟件沒罵你，可能是他心善吧。你家單片機RX接485的RX腳啊？單片機TX腳接485的TX腳啊？公對公，母對母？

用是都能用的，但個人傾向于圖二的方案   一款設備通過撥碼選擇是主機還是從機，也就是該設備同一時刻要么是主機要么是從機。如果用圖一的電路，軟件上切換為主機時需要將2個MCU串口都配置為主機模式，比圖二的方案需要多配置一套，要是通信協議的軟件封裝做得不錯，那軟件的工作量還好，要是協議的封裝與其他代碼高度耦合，那軟件的工作量可能就多不少了，硬件上圖一比圖二的方案多了一套485電路的成本

設備是做主機或做從機在物理層沒有區別，這完全是由軟件決定。
你的問題我沒明白。但知道上面這點只是，你應該自己就能解決。
圖2只有一組485線路，設備可以做主機，也可以做從機，但不能在同一時刻既是主又是從。
圖1有2組485線路，可以有4種模式選擇。1#從2#從、1#主2#從、1#從2#主，1#主2#主。